Investigadores identifican un factor de propagación del melanoma

Epidermis

Investigadores identifican un factor de propagación del melanoma

Utilizando un pequeño ARN no codificante, microARN 211 y herramientas que rastrean la estabilidad y la descomposición de los ARN codificantes y no codificantes de proteínas en células de melanoma cultivadas en laboratorio, un equipo dirigido por un investigador del Centro de Cáncer Johns Hopkins Kimmel identificó moléculas de ARN altamente inestables en humanos melanomas, incluido un nuevo gen objetivo miR-211 DUSP3.

Ranjan J. Perera, Ph.D., profesor asociado de oncología en la Facultad de Medicina de la Universidad Johns Hopkins, y sus colegas informan que utilizando un método especializado de secuenciación de transcripciones llamado BRIC-seq, han identificado transcripciones de genes de ARNm altamente estables e inestables que participan en  y la invasión durante la progresión del melanoma. Un gen, la fosfatasa 3 de doble especificidad (DUSP3), regula importantes vías de señalización del melanoma.

Informaron sus hallazgos el 16 de junio en RNA Biology .

Investigaciones anteriores en otros laboratorios mostraron que DUSP3 estaba involucrado en la progresión y propagación de varios tipos de cáncer, incluidos los cánceres de cuello uterino, de próstata y de mama. Se cree que el nuevo estudio es el primer informe de su participación en el melanoma y el primer informe de su regulación por miR-211, concluyeron los investigadores.

El melanoma ataca a aproximadamente 96,000 estadounidenses cada año, y mata a aproximadamente 7,200, lo que lo convierte en el cáncer de piel más mortal en los Estados Unidos, en gran parte debido a su naturaleza agresiva y su potencial de metástasis. Perera dice que se necesita más trabajo para comprender la biología anormal que subyace al crecimiento y la diseminación del cáncer, y para proporcionar nuevos objetivos potenciales para el tratamiento.

En general, dice Perera, los científicos abordan sus estudios de la genética del melanoma al observar qué productos de genes y proteínas están regulados hacia arriba o hacia abajo en las células tumorales en comparación con los progenitores normales de la piel. En cambio, dice, el enfoque de «estabilidad del transcriptoma» de su equipo analiza cuánto tiempo las llamadas transcripciones genéticas, las instrucciones moleculares de ARN que se «leen» del ADN antes de traducirlas en proteínas, sobreviven en las células tumorales antes de que se degraden.

«Es importante comprender durante la tumorigénesis o progresión tumoral cómo se comportan estas transcripciones», dice Perera. «Así que decidimos observar un ángulo completamente nuevo de estabilidad y descomposición del ARN en todo el genoma durante los primeros pasos en el desarrollo del melanoma», agrega.

Otros investigadores, señala Perera, han intentado perfilar la estabilidad de la transcripción del genoma completo mediante el uso de productos químicos que bloquean toda la transcripción, y luego observaron la estabilidad de las transcripciones que existían antes del bloqueo. Sin embargo, este método de mazo se considera tóxico y puede alterar otros aspectos de la biología de una célula de manera que puede oscurecer la información de estabilidad de la transcripción. Para abordar esto, Perera y sus colegas utilizaron BRIC-seq, un método que etiqueta las transcripciones con 5-bromouridina, que se incorpora a los ARN recién sintetizados y luego puede analizarse inmunocitoquímicamente con el tiempo sin alterar el resto del entorno celular.

En una línea celular de melanoma que normalmente carece de miR-211, los investigadores introdujeron la expresión de miR-211 y luego usaron el método BRIC-seq para investigar la dinámica de estabilidad del transcriptoma en presencia / ausencia de miR-211. Luego combinaron estos resultados con cambios en los niveles generales de expresión génica y utilizaron herramientas de predicción de programas informáticos para identificar los objetivos genéticos específicos de miR-211, descubriendo el objetivo DUSP3 previamente no informado.

Como parte de sus estudios en curso, Perera y sus colegas también están analizando cómo miR-211 podría afectar otras transcripciones de genes de melanoma de manera que promuevan la metástasis del cáncer y la resistencia a ciertos medicamentos contra el cáncer.

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